Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsjQ9R014 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsjQ9R014 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsjQ9R014 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsjQ9R014 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsjQ9R014 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsjQ9R014 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms