Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr4a3Q9QZB6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr4a3Q9QZB6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr4a3Q9QZB6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr4a3Q9QZB6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr4a3Q9QZB6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr4a3Q9QZB6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr4a3Q9QZB6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr4a3Q9QZB6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr4a3Q9QZB6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr4a3Q9QZB6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr4a3Q9QZB6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr4a3Q9QZB6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr4a3Q9QZB6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr4a3Q9QZB6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr4a3Q9QZB6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr4a3Q9QZB6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr4a3Q9QZB6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr4a3Q9QZB6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr4a3Q9QZB6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr4a3Q9QZB6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr4a3Q9QZB6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr4a3Q9QZB6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr4a3Q9QZB6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr4a3Q9QZB6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr4a3Q9QZB6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr4a3Q9QZB6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr4a3Q9QZB6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr4a3Q9QZB6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr4a3Q9QZB6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr4a3Q9QZB6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms