Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim44Q9QXA7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim44Q9QXA7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim44Q9QXA7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim44Q9QXA7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim44Q9QXA7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim44Q9QXA7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim44Q9QXA7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim44Q9QXA7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim44Q9QXA7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim44Q9QXA7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim44Q9QXA7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim44Q9QXA7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trim44Q9QXA7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms