Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psma6Q9QUM9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma6Q9QUM9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Psma6Q9QUM9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma6Q9QUM9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma6Q9QUM9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.6 ms