Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aldh9a1Q9JLJ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aldh9a1Q9JLJ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms