Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prg3Q9JL95 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prg3Q9JL95 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prg3Q9JL95 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prg3Q9JL95 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prg3Q9JL95 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prg3Q9JL95 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prg3Q9JL95 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prg3Q9JL95 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Prg3Q9JL95 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prg3Q9JL95 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prg3Q9JL95 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prg3Q9JL95 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prg3Q9JL95 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prg3Q9JL95 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prg3Q9JL95 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prg3Q9JL95 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prg3Q9JL95 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prg3Q9JL95 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prg3Q9JL95 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prg3Q9JL95 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prg3Q9JL95 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prg3Q9JL95 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prg3Q9JL95 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prg3Q9JL95 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prg3Q9JL95 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prg3Q9JL95 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prg3Q9JL95 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prg3Q9JL95 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prg3Q9JL95 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms