Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arl6ip1Q9JKW0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl6ip1Q9JKW0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl6ip1Q9JKW0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl6ip1Q9JKW0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms