Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufaf3Q9JKL4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufaf3Q9JKL4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf3Q9JKL4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf3Q9JKL4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf3Q9JKL4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf3Q9JKL4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf3Q9JKL4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf3Q9JKL4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf3Q9JKL4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf3Q9JKL4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufaf3Q9JKL4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufaf3Q9JKL4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufaf3Q9JKL4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufaf3Q9JKL4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms