Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx6Q9JKK1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stx6Q9JKK1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stx6Q9JKK1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stx6Q9JKK1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stx6Q9JKK1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stx6Q9JKK1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stx6Q9JKK1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stx6Q9JKK1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stx6Q9JKK1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stx6Q9JKK1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx6Q9JKK1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stx6Q9JKK1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stx6Q9JKK1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stx6Q9JKK1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stx6Q9JKK1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stx6Q9JKK1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stx6Q9JKK1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx6Q9JKK1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stx6Q9JKK1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stx6Q9JKK1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms