Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gfra4Q9JJT2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gfra4Q9JJT2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gfra4Q9JJT2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gfra4Q9JJT2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gfra4Q9JJT2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gfra4Q9JJT2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gfra4Q9JJT2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gfra4Q9JJT2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gfra4Q9JJT2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gfra4Q9JJT2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gfra4Q9JJT2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gfra4Q9JJT2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gfra4Q9JJT2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gfra4Q9JJT2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gfra4Q9JJT2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gfra4Q9JJT2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gfra4Q9JJT2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gfra4Q9JJT2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gfra4Q9JJT2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gfra4Q9JJT2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gfra4Q9JJT2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gfra4Q9JJT2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gfra4Q9JJT2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms