Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJE7

Fads3, Fatty acid desaturase 3, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fads3Q9JJE7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fads3Q9JJE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fads3Q9JJE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fads3Q9JJE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
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Fads3Q9JJE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fads3Q9JJE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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Fads3Q9JJE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fads3Q9JJE7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fads3Q9JJE7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fads3Q9JJE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fads3Q9JJE7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fads3Q9JJE7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fads3Q9JJE7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fads3Q9JJE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fads3Q9JJE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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Fads3Q9JJE7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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Fads3Q9JJE7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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Fads3Q9JJE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fads3Q9JJE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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Fads3Q9JJE7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fads3Q9JJE7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fads3Q9JJE7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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Fads3Q9JJE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fads3Q9JJE7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fads3Q9JJE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fads3Q9JJE7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fads3Q9JJE7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fads3Q9JJE7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Fads3Q9JJE7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Fads3Q9JJE7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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Fads3Q9JJE7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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Fads3Q9JJE7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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Fads3Q9JJE7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fads3Q9JJE7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Fads3Q9JJE7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fads3Q9JJE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Fads3Q9JJE7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fads3Q9JJE7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fads3Q9JJE7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fads3Q9JJE7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fads3Q9JJE7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fads3Q9JJE7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fads3Q9JJE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
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Fads3Q9JJE7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fads3Q9JJE7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fads3Q9JJE7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fads3Q9JJE7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fads3Q9JJE7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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