Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx21Q9JIK5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ddx21Q9JIK5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx21Q9JIK5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx21Q9JIK5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx21Q9JIK5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx21Q9JIK5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddx21Q9JIK5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx21Q9JIK5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx21Q9JIK5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx21Q9JIK5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx21Q9JIK5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx21Q9JIK5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx21Q9JIK5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms