Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn12Q9ET43 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn12Q9ET43 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn12Q9ET43 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn12Q9ET43 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn12Q9ET43 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms