Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim39Q9ESN2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim39Q9ESN2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim39Q9ESN2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim39Q9ESN2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim39Q9ESN2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim39Q9ESN2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim39Q9ESN2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim39Q9ESN2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim39Q9ESN2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms