Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnmdQ9EP64 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnmdQ9EP64 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnmdQ9EP64 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.52■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TnmdQ9EP64 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TnmdQ9EP64 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TnmdQ9EP64 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms