Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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