Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tysnd1Q9DBA6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tysnd1Q9DBA6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tysnd1Q9DBA6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tysnd1Q9DBA6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tysnd1Q9DBA6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tysnd1Q9DBA6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms