Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TcimQ9D915 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TcimQ9D915 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TcimQ9D915 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TcimQ9D915 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TcimQ9D915 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TcimQ9D915 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TcimQ9D915 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TcimQ9D915 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TcimQ9D915 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TcimQ9D915 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TcimQ9D915 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms