Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e2Q9D902 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e2Q9D902 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e2Q9D902 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2e2Q9D902 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e2Q9D902 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e2Q9D902 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e2Q9D902 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e2Q9D902 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e2Q9D902 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e2Q9D902 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms