Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Alg13Q9D8C3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Alg13Q9D8C3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Alg13Q9D8C3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Alg13Q9D8C3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Alg13Q9D8C3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Alg13Q9D8C3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Alg13Q9D8C3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Alg13Q9D8C3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Alg13Q9D8C3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Alg13Q9D8C3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Alg13Q9D8C3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Alg13Q9D8C3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Alg13Q9D8C3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Alg13Q9D8C3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Alg13Q9D8C3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Alg13Q9D8C3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Alg13Q9D8C3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Alg13Q9D8C3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Alg13Q9D8C3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Alg13Q9D8C3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Alg13Q9D8C3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Alg13Q9D8C3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Alg13Q9D8C3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Alg13Q9D8C3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Alg13Q9D8C3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms