Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tspan17Q9D7W4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tspan17Q9D7W4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tspan17Q9D7W4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tspan17Q9D7W4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Tspan17Q9D7W4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tspan17Q9D7W4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan17Q9D7W4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan17Q9D7W4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan17Q9D7W4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan17Q9D7W4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan17Q9D7W4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan17Q9D7W4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan17Q9D7W4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tspan17Q9D7W4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tspan17Q9D7W4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms