Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sh2d4aQ9D7V1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d4aQ9D7V1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh2d4aQ9D7V1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d4aQ9D7V1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d4aQ9D7V1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms