Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Klhl40Q9D783 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klhl40Q9D783 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl40Q9D783 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl40Q9D783 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl40Q9D783 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhl40Q9D783 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms