Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc81Q9D5W4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc81Q9D5W4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc81Q9D5W4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ccdc81Q9D5W4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ccdc81Q9D5W4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc81Q9D5W4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc81Q9D5W4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ccdc81Q9D5W4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Ccdc81Q9D5W4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ccdc81Q9D5W4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc81Q9D5W4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc81Q9D5W4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc81Q9D5W4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc81Q9D5W4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Ccdc81Q9D5W4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ccdc81Q9D5W4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ccdc81Q9D5W4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ccdc81Q9D5W4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ccdc81Q9D5W4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26,66■■□□□ 1,86
Ccdc81Q9D5W4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ccdc81Q9D5W4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ccdc81Q9D5W4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ccdc81Q9D5W4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc81Q9D5W4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,7 ms