Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp6v1e2Q9D593 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp6v1e2Q9D593 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp6v1e2Q9D593 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp6v1e2Q9D593 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp6v1e2Q9D593 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp6v1e2Q9D593 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp6v1e2Q9D593 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp6v1e2Q9D593 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp6v1e2Q9D593 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp6v1e2Q9D593 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp6v1e2Q9D593 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp6v1e2Q9D593 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp6v1e2Q9D593 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp6v1e2Q9D593 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp6v1e2Q9D593 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp6v1e2Q9D593 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp6v1e2Q9D593 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp6v1e2Q9D593 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms