Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc83Q9D4V3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc83Q9D4V3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc83Q9D4V3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc83Q9D4V3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc83Q9D4V3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc83Q9D4V3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms