Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4931423N10RikQ9D4J9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
4931423N10RikQ9D4J9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4931423N10RikQ9D4J9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4931423N10RikQ9D4J9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
4931423N10RikQ9D4J9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
4931423N10RikQ9D4J9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
4931423N10RikQ9D4J9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
4931423N10RikQ9D4J9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4931423N10RikQ9D4J9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4931423N10RikQ9D4J9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4931423N10RikQ9D4J9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4931423N10RikQ9D4J9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
4931423N10RikQ9D4J9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
4931423N10RikQ9D4J9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4931423N10RikQ9D4J9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4931423N10RikQ9D4J9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4931423N10RikQ9D4J9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
4931423N10RikQ9D4J9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4931423N10RikQ9D4J9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
4931423N10RikQ9D4J9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
4931423N10RikQ9D4J9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4931423N10RikQ9D4J9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
4931423N10RikQ9D4J9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
4931423N10RikQ9D4J9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms