Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933428M09RikQ9D3X3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933428M09RikQ9D3X3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933428M09RikQ9D3X3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933428M09RikQ9D3X3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms