Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rufy3Q9D394 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rufy3Q9D394 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rufy3Q9D394 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rufy3Q9D394 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rufy3Q9D394 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Rufy3Q9D394 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rufy3Q9D394 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rufy3Q9D394 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rufy3Q9D394 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rufy3Q9D394 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rufy3Q9D394 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rufy3Q9D394 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rufy3Q9D394 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rufy3Q9D394 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rufy3Q9D394 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rufy3Q9D394 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rufy3Q9D394 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rufy3Q9D394 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rufy3Q9D394 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rufy3Q9D394 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rufy3Q9D394 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rufy3Q9D394 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms