Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp5Q9D387 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp5Q9D387 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp5Q9D387 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp5Q9D387 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp5Q9D387 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamp5Q9D387 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp5Q9D387 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp5Q9D387 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lamp5Q9D387 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp5Q9D387 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp5Q9D387 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms