Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2cQ9D1C1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2cQ9D1C1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2cQ9D1C1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2cQ9D1C1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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