Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl28Q9D1B9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mrpl28Q9D1B9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl28Q9D1B9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl28Q9D1B9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms