Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Susd3Q9D176 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Susd3Q9D176 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Susd3Q9D176 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Susd3Q9D176 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Susd3Q9D176 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Susd3Q9D176 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Susd3Q9D176 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Susd3Q9D176 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Susd3Q9D176 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Susd3Q9D176 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Susd3Q9D176 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Susd3Q9D176 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Susd3Q9D176 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Susd3Q9D176 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Susd3Q9D176 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,8 ms