Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem53Q9D0Z3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem53Q9D0Z3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem53Q9D0Z3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem53Q9D0Z3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem53Q9D0Z3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms