Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Arv1Q9D0U9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arv1Q9D0U9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Arv1Q9D0U9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arv1Q9D0U9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arv1Q9D0U9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arv1Q9D0U9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms