Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thumpd2Q9CZB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Thumpd2Q9CZB3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thumpd2Q9CZB3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thumpd2Q9CZB3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Thumpd2Q9CZB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Thumpd2Q9CZB3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thumpd2Q9CZB3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Thumpd2Q9CZB3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Thumpd2Q9CZB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Thumpd2Q9CZB3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Thumpd2Q9CZB3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Thumpd2Q9CZB3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Thumpd2Q9CZB3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Thumpd2Q9CZB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms