Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrtapQ9CYD3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrtapQ9CYD3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CrtapQ9CYD3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrtapQ9CYD3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CrtapQ9CYD3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CrtapQ9CYD3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CrtapQ9CYD3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrtapQ9CYD3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrtapQ9CYD3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrtapQ9CYD3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms