Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ssr1Q9CY50 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ssr1Q9CY50 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ssr1Q9CY50 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ssr1Q9CY50 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ssr1Q9CY50 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ssr1Q9CY50 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ssr1Q9CY50 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ssr1Q9CY50 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssr1Q9CY50 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssr1Q9CY50 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ssr1Q9CY50 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssr1Q9CY50 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssr1Q9CY50 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssr1Q9CY50 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms