Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl11Q9CXW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl11Q9CXW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl11Q9CXW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms