Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sugt1Q9CX34 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sugt1Q9CX34 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sugt1Q9CX34 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sugt1Q9CX34 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sugt1Q9CX34 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sugt1Q9CX34 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sugt1Q9CX34 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms