Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cxxc1Q9CWW7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxxc1Q9CWW7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxxc1Q9CWW7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxxc1Q9CWW7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxxc1Q9CWW7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cxxc1Q9CWW7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms