Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BccipQ9CWI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BccipQ9CWI3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BccipQ9CWI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BccipQ9CWI3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BccipQ9CWI3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BccipQ9CWI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms