Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB2

Nhp2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhp2Q9CRB2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhp2Q9CRB2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhp2Q9CRB2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhp2Q9CRB2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nhp2Q9CRB2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhp2Q9CRB2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhp2Q9CRB2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhp2Q9CRB2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhp2Q9CRB2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhp2Q9CRB2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhp2Q9CRB2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhp2Q9CRB2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhp2Q9CRB2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms