Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exosc5Q9CRA8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exosc5Q9CRA8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc5Q9CRA8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Exosc5Q9CRA8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc5Q9CRA8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exosc5Q9CRA8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.3 ms