Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gadd45gip1Q9CR59 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gadd45gip1Q9CR59 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gadd45gip1Q9CR59 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gadd45gip1Q9CR59 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gadd45gip1Q9CR59 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gadd45gip1Q9CR59 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms