Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl28Q9CR40 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl28Q9CR40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl28Q9CR40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl28Q9CR40 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl28Q9CR40 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl28Q9CR40 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl28Q9CR40 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms