Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmd9Q9CR00 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmd9Q9CR00 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmd9Q9CR00 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd9Q9CR00 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd9Q9CR00 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd9Q9CR00 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psmd9Q9CR00 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd9Q9CR00 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd9Q9CR00 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd9Q9CR00 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psmd9Q9CR00 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmd9Q9CR00 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd9Q9CR00 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd9Q9CR00 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd9Q9CR00 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd9Q9CR00 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd9Q9CR00 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd9Q9CR00 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms