Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpb2Q9CQI7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpb2Q9CQI7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpb2Q9CQI7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snrpb2Q9CQI7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpb2Q9CQI7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms