Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC5

Cdc42ep3, Cdc42 effector protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep3Q9CQC5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdc42ep3Q9CQC5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc42ep3Q9CQC5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep3Q9CQC5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep3Q9CQC5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep3Q9CQC5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms