Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4921530L21RikQ9CQ47 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4921530L21RikQ9CQ47 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4921530L21RikQ9CQ47 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms